Devant l’essor de la biologie moléculaire, une nouvelle approche diagnostique des infections gastro-intestinales, l’approche syndromique, a vu le jour et de nombreux panels de Polymerase Chain Reaction (PCR) multiplex ont été développés. Ce contexte nous a conduits à évaluer le système de biologie moléculaire BD MAX™ (BD Diagnostics, USA) ainsi que l’intégration d’un tel automate dans une routine de laboratoire périphérique. Les résultats obtenus avec ce système ont été comparés aux méthodes conventionnelles utilisées dans notre laboratoire de microbiologie. Nous avons évalué non seulement ses performances mais également les avantages de l’approche syndromique par biologie moléculaire en termes pratiques : diminution du nombre d’ équivalents temps plein (ETP) technologue nécessaire par jour pour effectuer les analyses microbiologiques sur les selles, amélioration du temps de rendu des résultats, gestion des stocks facilitée et traçabilité complète pour chaque échantillon clinique des lots de réactifs, leur date de péremption ainsi que l’utilisateur de l’appareil, facilité d’utilisation de l’appareil BD MAX™ nécessitant peu de formation et connexion bidirectionnelle avec le Laboratory Information System (LIS) permettant un encodage plus fiable des résultats. Devant le faible rendement et le volume de temps important consacré au poste du diagnostic gastro-intestinal, les panels moléculaires ont déjà remplacé les méthodes conventionnelles dans certains laboratoires. Les performances analytiques de certains de ces panels sont tout-à-fait satisfaisantes et leur prix devient de plus en plus abordable. Chaque laboratoire de microbiologie peut donc envisager l’intégration d’un panel PCR multiplex dans son travail de routine.